学校制定《上海市南洋中学（2016—2020）发展规划》，明确学校的发展目标与办学理念等。要做强特色。坚持科学育人的教育理念，弘扬求学报国的传统，进一步发展科技、体育、心理教育等办学特色，在积淀深厚的学校文化传承上促进教师专业发展、提升办学品质。要提高质量。推进初高中“一体贯通”，改革传统的课堂教学模式，加强教育信息化，打造科技化、现代化的数字校园，依法治教，全面提升教育教学质量，建设与徐汇滨江地位、发展相称的、特色鲜明的优质的上海市实验性示范性高中和新优质初中示范校。

根据上海市高考改革方案，全面落实市、区各项综改、教改任务。包括：上海市体育专项化改革、初高中一体化改革、基于课程标准实践研究等。同时，结合学校科技、心理、体育特色，推进校本化改革项目实施。