学校制定、公开并实施《上海市南洋中学学校章程》，加强对学校依法治理工作的领导，坚持“以人为本，以法为准”的宗旨，抓好依法治校各项措施的落实，增强全校师生的法律素质，推动教育系统民主法制建设，实现依法治理与教育事业同步发展。德育处负责开展法制宣传教育活动，通过大屏幕、展板等加强宣传，组织学生参观上海市公安博物馆。组织学生收看宪法日宣传视频。

学校有一系列人事、财务、科研、后勤等管理制度，校长作为法人代表，将责任分解到各部门，并加强监督与落实。